Il Museo d’Annunzio Segreto, inaugurato nel 2010 nel grande spazio espositivo del sottoteatro, è il primo spazio museale che il visitatore incontra entrando dalla biglietteria. Il museo raccoglie quanto fino ad ora era rimasto sconosciuto al grande pubblico perché chiuso negli armadi e nei cassetti della Prioria, da qui il nome “d’Annunzio Segreto”. La collezione permanente del museo raccoglie oggetti personali ed intimi del poeta e delle sue ospiti, come abiti, camicie da notte, scialli, sottovesti ma anche gioielli, scarpe, stivali, oggetti da scrivania e vasellame da tavola. Non solo oggetti personali, nel museo sono esposti anche i collari dei suoi amati cani, le boccette dei profumi da lui utilizzati e le ampolle della celebre Aqua Nuntia, il profumo ideato dal poeta stesso.
Il museo ospita al suo interno anche mostre temporanee in un allestimento che riprende i caratteri delle stanze interne alla Prioria, con una luce soffusa in grado di creare una particolare atmosfera e consentire al turista di immergersi nello spirito del Vittoriale.
All’ingresso del museo sei schermi trasmettono alcuni filmati d’epoca sul poeta d’Annunzio e sul periodo storico, tratti dall’archivio del Vittoriale, dall’Istituto Luce e dall’Archivio storico RAI.
A vegliare sui preziosi oggetti del Comandante all’ingresso del museo due sculture in bronzo dell’artista Ugo Riva, Il Grande Angelo e L’altro angelo, che accolgono anche i visitatori dalla platea del teatro.